Curso

Nombre Guerrero Flores Shaday
Curso Temas selectos de análisis numérico y computación científica I - 4.5 hrs/sem
Tema Bioinformática y análisis de datos metagenómicos
Objetivo
Temario 1. Introducción a la bioinformática
a. Introducción y algoritmos biológicos.
b. Bases de datos y paquetes de análisis.
c. Redes de información y estructura de proteínas.
d. Análisis de secuencias.
e. Árboles y metadatos.
f. Primeros pasos en lenguaje Bash.
g. Importancia del trabajo en paralelo (funcion Screen).
2. Metagenómica
a. Organizacion de proyectos en metagenómica.
b. Control de calidad de las muestras.
c. Mejorará la calidad.
d. Ensamblado de metagenómicas.
e. Binning de metagenoimas.
f. Asignación taxonómica.
3. Analisis de datos con R
a. Diversidad microbiana con R.
b. Analisis taxonómicos.
4. Buenas practicas en la bioinformatica.
a. Introducción a GitHub.
b. Introducción a Docker.
d. Crear un contenedor Docker
d. Paquetes conda.
Proyectos con datos metagenomicos
Bibliografía
Requisitos
Comentarios
Registro 2023-11-18