| Nombre | Azpeitia Eugenio |
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| Curso | Temas selectos de análisis numérico y computación científica I - 4.5 hrs/sem |
| Tema | Modelado matemático dinámico del crecimiento de las plantas, desde procesos genéticos hasta su morfología |
| Objetivo | El curso buscará estudiar las diferentes metodologías que existen para modelar el crecimiento de las plantas y como se pueden acoplar dichas metodologías para realizar un modelo multiescala que los integre. Para esto revisaremos modelos de ecuaciones diferenciales (ordinarias y parciales) de procesos biomoleculares de las plantas, modelos de teselaciones celulares, y gramáticas formales con sistemas de reescrituración del tipo de sistemas L para reproducir morfologías de plantas a nivel macroscópico. |
| Temario | El curso se dividirá en cuatro partes: 1) Modelado de los procesos biomoleculares por medio de ecuaciones diferenciales ordinarias y parciales. 2) Modelado celular por medio de teselaciones tipo Voronoi. 3) Sistemas L y gramáticas formales para el modelado macroscópico de las forma de las plantas. 4) Modelado multiescala, integrado procesos moleculares, celulares y macroscópicos. |
| Bibliografía | Seguiremos capítulos de los siguientes libros: Brian Ingalls. Mathematical Modeling in Systems Biology: An Introduction. Uri Alon. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits (Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology). Lee A. Segel. Mathematical Models in Molecular Cellular Biology Przemyslaw Prusinkiewicz y Aristid Lindenmayer. The Algorithmic Beauty of Plants |
| Requisitos | Conocimiento básico de: Programación básica (de preferencia en python). Ecuaciones diferenciales (ordinarias y parciales) y como solucionarlas numéricamente. Bases de biología del desarrollo y biología molecular de la célula. |
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| Registro | 2023-10-16 |